Page 11 - pest-POSTEN nr 3-4, 2020

Side 11 -pest-POSTEN

Doktorgrad

Karl Erik Müller

disputerte for ph.d-graden Illustrasjon: Colourbox
den 29. mai 2020 ved
Universitetet i Bergen

Diagnostikk og artsidentifisering er viktig for
valg av behandling og oppfølging. Arginine
er viktig for makrofagens immunreaksjon mot
parasitten, men er også essensiell for Leishmanias
replikasjon i makrofagene. Parasitten tar opp
arginine via aminosyrepermease 3 (AAP3). Vi
ønsket i dette prosjektet å undersøke hvorvidt aap3
sine kodende regioner (CDS) og omkringliggende
nukleotidsekvenser kunne brukes til deteksjon
av parasitten og artsidentifisering. Vi fant ut
at aap3 er et godt målgen for deteksjon av
Leishmania ved hjelp av sanntids-PCR. Videre
brukte vi høyresolusjons smeltepunktsanalyse
Avhandlingens tittel: “Characterisation of (HRM-analysis) for artsidentifisering. Til tross
Leishmania amino acid permease 3 (AAP3) for at aap3 finnes i to kopier fant vi at det er et
coding sequences and flanking regions as a target relativt sensitivt og spesifikt målgen, noe som
of detection and diagnosis of the leishmaniases” gjør det egnet også for blant annet å kvantifisere
Hovedveileder: professor Audun Helge Nerland parasitter i vev. Samtidig fant vi at målgen som
(UiB) finnes i mange flere kopier, som 18s rDNA,
var mer sensitive. Til slutt undersøkte vi aap3
Biveiledere: professor Lucile Maria Floeter- sine kodende regioner og omkringliggende
Winter (Universitetet i São Paulo, Brasil) og nukleotidsekvenser med single-molecule real-
dr. Juliana Ide Aoki (Universitetet i São Paulo, time (SMRT) sekvensering. Ved å bruke denne
Brasil)
teknologien, fant vi at de kodende regionene er
Første opponent: professor Anja Tatiana relativt konservert, mens de omkringliggende
Ramstedt Jensen, Københavns Universitet ikke-kodende var mer variable. Konklusjonen
Andre opponent: dr. Alvaro Acosta Serrano, i arbeidet var at ved bruk av riktig teknologi
kan aap3 være et sensitivt og spesifikt målgen
Liverpool School of Tropical Medicine
for både parasittdeteksjon og artsidentifisering.
Leishmaniasis er forårsaket av protozoen I tillegg danner sekvenseringsstudiene et viktig
Leishmania og av Verdens helseorganisasjon grunnlag for pågående genredigeringsstudier i
definert som en neglisjert tropesykdom. forskningsgruppen.