Page 23 - pest-POSTEN nr 4, 2021
P. 23

Side 23                -pest-POSTEN


        alvorlig K. pneumoniae infeksjon og død. Denne   i  AMR-spredning og patogenisitet,  inkludert
        studien forventes publisert våren 2022.   resistomanalyser.  Prøvematerialet  inkluderer
                                                  avføringsprøver fra dyr i norsk kjøttproduksjon
        Det norske  Klebsiella  pneumoniae nettverket   og longitudinelle avføringsprøver fra voksne
        (NOR-KLEB-NET) ble etablert  i 2017. Det er   deltakere i Tromsøundersøkelsen.
        finansiert  av forskningsrådet og ledes av SUS
        i  samarbeid  med  UiT.  Dette  er  et  Èn-helse   WP3  “Geno-  and  phenotype  associations  in
        nettverk  hvor vi har som målsetning  å studere   AMR and virulence prediction”: Målsetningene
        K. pneumoniae og antibiotikaresistens  på tvers   er 1) å identifisere  nye virulensfaktorer  hos
        av ulike nisjer, dvs. hos mennesker, dyr og i det   K. pneumoniae ved å kombinere genotypiske og
        marine miljøet. Gjennom dette nettverket har vi   kliniske data med in vitro immunologiske analyser
        etablert et godt samarbeid med Veterinærinstituttet   ved hjelp av «genome wide association studies»
        (VI) og Havforskningsinstituttet  (HI) med   (GWAS), og 2) å predikere antibiotikaresistens
        flere. Vi har også knyttet  til oss internasjonale   og virulens basert på genotypiske data ved hjelp
        samarbeidspartnere  med    relevant   og  av kunstig intelligens.
        komplementær  kompetanse  innen forskning på   WP4 “Phage therapy against MDR K.
        K. pneumoniae, antibiotikaresistens, patogenese,   pneumoniae”:  Målsetningen er å isolere og
        bakteriofager og bioinformatikk.
                                                  karakterisere  strikt lytiske K. pneumoniae
        KLEB-GAP-prosjektet («Klebsiella pneumoniae   spesifikke bakteriofager for så å gjøre prekliniske
        – en sentral  aktør i den globale  spredningen   effektstudier av bakteriofager som behandling av
        av antibiotikaresistens og målbakterie  for   kolonisering og infeksjon med multiresistente K.
        nyskapende  diagnostikk,  overvåkning  og  pneumoniae i dyremodeller.
        alternativ  behandling»)  er  utgående  fra  NOR-  Referanser:
        KLEB-NET og inkluderer seks nasjonale (HI,
        SUS, UNN, UiT, VI og industripartner STIM) og   1.  Cassini A et al., Lancet Infect Dis, 2018.
        fire internasjonale partnere (Karolinska, London   2.  NORM/NORM-VET 2020: https://
        School of Hygiene & Tropical Medicine, Institùt   unn.no/fag-og-forskning/norm-
        Pasteur i Paris, og Queens University  Belfast.   norsk-overvakingssystem-for-
        Prosjektet er finansiert av Trond Mohn stiftelsen   antibiotikaresistens-hos-mikrober
        (2019-24) og ledes av UiT i samarbeid med SUS.   3.  Shon AS et al., Virulence, 2013.
        Prosjektet består av fire arbeidspakker:
                                                    4.  Lam MMC et al, J Antimicrob Chemother,
        WP1 “K. pneumoniae ecology and AMR in a One    2019.
        Health  perspective”:  Arbeidspakken  inkluderer
        ca 3500 K. pneumoniae genomer fra mennesker,   5.  Wyres KL, Holt KE, Curr Opin Microbiol,
        dyr og det marine miljøet, og har som målsetning   2018.
        å fremskaffe ny kunnskap om  K. pneumoniae   6.  Fostervold A et al., J Antimicrob
        og assosiert  antibiotikaresistens knyttet  til   Chemother, accepted Oct. 2021. (available
        forekomst, populasjonsstruktur og pangenom i et   at: https://www.biorxiv.org/content/10.110
        Én-helse perspektiv. Ved hjelp av modellering vil   1/2021.07.16.452602v1 )
        vi undersøke om spesifikke kloner er adaptert til   7.  Raffelsberger RN et al., Gut Microbes,
        spesifikke nisjer eller om de beveger seg på kryss   2021.
        av nisjer.
        WP2 “Next generation  AMR-diagnostics and
        surveillance”:  Målsetningen  er å sammenligne
        tradisjonell  dyrkning  med   qPCR    og
        metagenomikk  i påvisning  og karakterisering
        av  klonale  linjer av  K. pneumoniae  involvert
   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28