Page 22 - pest-POSTEN nr 1, 2021

-pest-POSTEN Side 22

To mikrobiologer presenterer....

Diagnostikk av SARS-CoV-2 varianter

Elling Ulvestad og Øyvind Kommedal
Mikrobiologisk avdeling, Haukeland universitetssykehus,
Klinisk institutt 2, Universitetet i Bergen

Teknologiske framskritt har gjort 2020), og den brasilianske varianten (B.1.1.28,
mikrobiologiske laboratorier i stand beskrevet desember 2020) (1). I hvor stor grad
til å levere stadig mer finmasket økt spredningspotensial skyldes egenskaper
ved virusvariantene, eller om det heller skyldes
utbruddsdiagnostikk. Neste steg blir miljøfaktorer, samhandlingsmønstre og
å avklare hvordan kunnskapen best demografiske forhold, er fortsatt uavklart. Heller
kan anvendes for å optimalisere ikke er det endelig avklart om variantene gir økt
smittehindrende handlinger og eller redusert sykdomsbyrde.
strategier. Variantanalyse

Sars-CoV-2 er et muterende virus. Ulike Mot slutten av pandemiens første år ble de første
varianter vil kunne selekteres fram under et varianter med mulig klinisk betydning identifisert
sykdomsforløp, og viruset en person ble smittet i Norge, og mikrobiologiske laboratorier trappet
med vil derfor ikke nødvendigvis være identisk dermed opp innsatsen for å identifisere variantene.
med viruset personen sender videre til nestemann Begrunnelsen for opptrapping var smittesporing
i smittekjeden. Virusets endringspotensial har og overvåkning av pandemiens utbredelse.
gitt opphav til multiple varianter med endret evne
til reproduksjon og spredning, og noen av disse Mikrobiologisk avdeling ved Haukeland
vil - som følge av naturlig seleksjon – kunne bli universitetssykehus startet 1. februar 2021 å
dominerende i ulike befolkningsgrupper. analysere alle positive prøver i regionen for kjente
mutasjoner. Alle sars-CoV-2 positive prøver ble
I hvor stor grad konkurransen mellom sars- screenet for de tre vanligste variantene ved PCR,
CoV-2 varianter i den enkelte pasient bidrar til å og prøver som slo ut positivt ble deretter sanger-
forklare et sykdomsforløp, har vært lite påaktet. sekvensert for fastsettelse av varianttilhørighet.
Mer diskutert har det vært om varianter av sars-
CoV-2 vil kunne mutere og derved unnvike Utbruddet i Ulvik og
deteksjon ved serologisk og molekylærbiologisk smitteutviklingen i Bergen
testing, om varianter vil kunne endre pandemiens Ulvik herad med 1067 innbyggere innerst i
forløp, og om enkelte varianter vil kunne unnvike Hardangerfjorden hadde inntil januar 2021 kun
immunresponsen etter vaksinasjon eller etter hatt seks Sars-CoV-2-smittede innbyggere. Dette
tidligere smitte med andre varianter. tallet endret seg raskt etter at to nye innbyggerne
Nærmere ett år ut i pandemien har tre sars- testet positivt den 27. januar.
CoV-2 varianter fått ord på seg for å være Fra Figur 1 blir det tydelig hvordan smitten tok av
særlig spredningsdyktige. Disse har – i klassisk gjennom den første uken av februar og hvordan
utbruddsterminologi – fått navn etter hvor dette igjen avstedkom økt behov for prøvetaking.
de først ble identifisert: Den sørafrikanske
(Pango linje B.1.351, beskrevet august 2020), I perioden fram til 8. februar ble det tatt 300
den britiske (B.1.1.7, beskrevet september prøver (28% av befolkningen), hvorav 92 var